1914年、若き言語学者マイロは、失われた大陸「アトランティス」の発見を夢見て研究を続けていた。ある日、亡き祖父の知人という大富豪ウィットモア卿が現れ、アトランティスの謎を解く鍵を握るといわれる伝説の古文書「羊飼いの日誌」をマイロに渡す。そしてウィットモア卿が出資するアトランティス探検隊に参加することになったマイロは、8人の仲間と共に遙かなる海底の旅に出る。日誌を手掛かりに海底を進む探検隊一行だったが、突如巨大な怪物が彼らに襲いかかる。危機一髪、脱出艇で逃れたマイロ達は海底から不思議な空間に入り込み、ついにアトランティスを発見する。そこで彼らを待っていたのは、想像を絶する神秘の世界だった。
＜ウォルト・ディズニー生誕100周年記念作品＞

（スタッフ）
　監督：ゲイリー・トゥルースデイル、カーク・ワイズ
　脚本：タブ・マーフィー
　制作：ドン・ハーン
　音楽：ジェームズ・ニュートン・ハワード
　原作：ジュール・ベルヌ

（キャスト）
　マイロ・サッチ　　：マイケル・J・フォックス
　プリンセス・キーダ：クリー・サマー
　アトランティス王　：レナード・ニモイ
　ドクター・スイート：フィル・モリス
　ヘルガ　　　　　　：クローディア・クリスチャン
　オードリー　　　　：ジャクリーン・オブラドーズ
　ローク隊長　　　　：ジェームズ・ガーナー